基因組原位雜/交技術
基因組原位雜/交(Genome in situ hybridization，GISH)技術是20世紀80年代末發展起來的一種原位雜/交技術。它主要是利用物種之間DNA同源性的差異，用另一物種的基因組DNA以適當的濃度作封阻，在靶染色體上進行原位雜/交。GISH技術剛開始應用于動物方面的研究(Pinkel et al.,1986)，在植物上剛開始應用于小麥雜/ zhong和栽培種的鑒定(余舜武等 2001；王文奎等 2000)。
熒光原位雜/交技術
熒光原位雜/交(Fluorescence in situ hybridization，FISH)技術是在已有的放射性原位雜/交技術的基礎上發展起來的一種非放射性DNA分子原位雜/交技術。它利用熒光標記的核酸片段為探針，與染色體上或DNA顯微切片上的特異fl-N：~行雜/交，通過熒光檢測系統(熒光顯微鏡)檢測信號DNA序列在染色體或DNA顯微切片上的目的DNA序列，進而確定其雜/交位點。FISH技術檢測時間短，檢測靈敏度高，無污染，已廣泛應用于染色體的鑒定、基因定位和異常染色體檢測等領域。FISH是原位雜/交技術大家族中的一員，因其所用探針被熒光物質標記（間接或直接）而得名，該方法在80年代末 被發明，現已從實驗室逐步進入臨床診斷領域。 基本原理是熒光標記的核酸探針在變性后與已變性的靶核酸在退火 溫度下復性；通過熒光顯微鏡觀察熒光信號可在不改變被分析對象（即維持其原位）的前提下對靶核酸進行分析。 DNA熒光標記探針是其中/常/用的一類核酸探針。利用此探針可對組織、細胞或染色體中的DNA進行染色體及基因水平 的分析。熒光標記控針不對環境構成污染，靈敏度能得到保障，可進行多色觀察分析，因而可同時使用多個探針，縮 短因單個探針分開使用導致的周期過程和技術障礙。
多彩色熒光原位雜/交技術
多彩色熒光原位雜/交(Multicolor fluorescence in situ hybridization，mFISH)是在熒光原位雜/交技術的基礎上發展起來的一種新技術，它用幾種不同顏色的熒光素單獨或混合標記的探針進行原位雜/交，能同時檢測多個靶位，各靶位在熒光顯微鏡下和照片上的顏色不同，呈現多種色彩，因而被稱為多彩色熒光原位雜/交。它克服了FISH技術的局限，能同時檢測多個基因，在檢測遺傳物質的突變和染色體上基因定位等方面得到了廣泛的應用(楊明杰等1998)。
原位PCR
原位雜/交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術，在細胞（爬片、甩片或涂片）或組織（石蠟、冰凍切片）上直接對靶基因片段進行擴增，通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜/交進行檢測的方法。
